A partir del 01 de agosto de 1992 por Resolución Exenta N° 2322 de Secreduc, el liceo pasa a llevar el nombre de Nuestra Patrona: «Nuestra Señora de la Merced», continuando la escuela con su nombre de origen.
En el año 1993 se logra uno de los sueños más anhelados por la Comunidad Educativa, se inaugura el Gimnasio deportivo en calle Vicuña Mackenna.
Pero no estaba todo concluido, la infraestructura se hizo insuficiente y poco a poco, siempre con mucho esfuerzo, se han ido construyendo más salas, es así como el 3 de julio de 1998 bajo la dirección de Sor Amelia Basai Nuñez se inaugura cinco nuevas salas , donde tres de ellas se ubican en un segundo piso por calle Vicuña Mackenna.
Bajo la dirección de Sor Carmen Rodríguez en el año 2002, por la excelente educación Técnico Profesional impartida por el liceo, se hace necesaria la ampliación a cursos paralelos en la Enseñanza media.
Así también en este período se adquiere un terreno ubicado en calle Ramón Freire, donde se construyó un moderno edificio que alberga a la enseñanza Parvularia, inaugurándose en el año 2002, siendo éste uno de los tantos sueños que anhelaron anteriores directoras.
Bajo la Dirección de Sor Teresita Campos Leiva, unida a un gran esfuerzo de la Comunidad religiosa, se concluye edificio con cuatro modernas salas y oficinas, que albergan al primer ciclo básico, las que se inauguran en el año 2003. En el mismo año se amplía la educación Parvularia en el nivel Transición Uno, aumentando a dos cursos en el año 2004.
Bajo la misma dirección, se adquiere una nueva propiedad colindante que es utilizada para la atención de alumnos y apoderados, favoreciendo a los Departamentos de Orientación y Pastoral.
En el transcurso de los años 2008 – 2009, siendo directora Sor Florisia Vásquez Hernández, se construye el actual y moderno edificio del liceo, el que se inaugura en el año 2010.
También en esta administración se decide volver a implementar la Enseñanza Humanístico Científica como una forma de dar respuesta a la vocación que desde años solicitaba un sector de la comunidad educativa.
Actualmente el colegio tiene 32 cursos, desde enseñanza Prebásica hasta las enseñanzas media Técnico Profesional y Humanístico científica.
